菌血症是感染性心内膜炎发生的必要条件，器质性心脏病患者为感染性心内膜炎高危易感人群。血液中的细菌可来自口腔，牙齿及皮肤表面。人体口腔和皮肤含有至少500多种微生物，它们能随着拔牙、洗牙或刷牙动作或是皮肤黏膜破损而跑到血液中，研究表明，口腔科操作时细菌入血的发生机率10-100%。但对大多数人而言，细菌不会在血液中的存活太久，体内免疫细胞会将它们清除。而对于心脏动过手术，植入人工瓣膜或者有先天性心脏病的人，细菌则很容易在心脏瓣膜附着，形成赘生物，导致感染性心内膜炎。